光行资源网提供的聚类软件精简版是一款十分功能强大的物件等位基因頻率分析工具，该软件功能齐全，如物件杂合度，信息内容成分这些开展剖析测算，还能够将测算截屏以图型的方法呈现出去，让客户可以更强的开展科学研究剖析。聚类软件这款软件可以测算剖析的內容也是十分的多，如欧式距离，多态性，基因遗传间距，聚类算法测算这些，十分便捷。有必须 的盆友赶快来免费下载这款软件吧。

聚类软件最新版本这款软件实际操作方法简易，沒有一切难度系数，再再加上数据可视化的作用栏，客户能够轻轻松松寻找必须 的作用功能键并开展应用。

聚类分析软件安装步骤

1、在本站下载聚类分析软件官方版这款软件的压缩包，解压后，双击exe，进入安装界面，点击下一步

2、设置软件安装位置，点击浏览可以修改默认在C盘的安装位置，建议大家选择安装在D盘，然后点击下一步

3、选择持续文件夹，默认即可，点击下一步

4、选择是否创建软件快捷方式，选择是，点击下一步

5、确认软件安装信息，点击下一步

6、聚类分析软件官方版软件正在安装，等待完成即可

聚类分析软件使用方法

1、安装完成点击桌面上的软件打开，界面如图所示。

2、点击定义矩阵，可以在这里控制数据的矩阵，定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数（位点数）只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

3、输入数据，将您的分析数据文件导入软件中进行分析，按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

4、数据正规化，可以将数据自动排版，将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

5、计算命令，您可以通过鼠标点击不同的计算项目进行数据分析，具有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、进行聚类计算

6、数据查看及保存命令、查看原始数据、查看遗传距离、保存聚类图、保存矩阵、数据导出

聚类分析软件常见问题

一.如何定义矩阵?

1、运行软件，点击“定义矩阵”

2、设置矩阵大小

3、点击确定即可

二.如何查看聚类分析软件官方版的帮助文件?

在聚类分析软件官方版软件主页点击“帮助”即可快速查看帮助文件

聚类分析软件功能介绍

1、定义矩阵

定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据；分类数（位点数）只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据，2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

2、输入数据

按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

3、读入数据

将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统，系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵，并将全部数据读入。

4、追加数据

在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据，主要用于计算遗传距离。

5、读入遗传距离

将保存到磁盘上的遗传距离数据读入，可直接用于聚类计算。

6、数据正规化

将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

7、计算杂合度

按照Nei氏公式（1974）计算出各品种的杂合度。

8、计算多态性

按照Nei氏公式（1974）计算出各品种的多态信息含量。

9、计算欧氏距离

在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注：如未在“定义矩阵”中定义分类数（等位基因数），则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

10、计算遗传距离

在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Nei氏公式（1983）计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

11、进行聚类计算

在已计算或读入遗传距离后，可用此命令按P.H.A.Sneath等（1973）的类平均聚类法（UPGMA法，又称非加权算术平均数成对聚类法）进行系统聚类。聚类结果说明：第1列No为序列号，代表是第几次聚类；第2列D为距离系数；第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种，第5列Cluster为聚类后的新名称，第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

12、查看原始数据

将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

13、查看遗传距离

将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

14、查看聚类图

按照聚类后的结果自动画出聚类图。

15、保存聚类图

将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能！

16、保存矩阵

将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据，则保存原始数据；若为经过正规化处理过的数据，则保存经过处理的数据；若为杂合度，则保存杂合度;。。。。。。;若为聚类结果，则保存聚类结果。未注册用户无此功能！

17、数据导出

系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据，并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能！

软件作用

聚类分析软件，是一款非常好用的物品等位基因频率分析工具！该软件功能强大，如物品杂合度，信息含量等等进行分析计算，还可以将计算截图以图形的方式展现出来，让用户能够更好的进行研究分析。聚类分析软件这款软件能够计算分析的内容也是非常的多，如欧氏距离，多态性，遗传距离，聚类计算等等，非常方便。有需要的朋友赶紧来下载这款软件吧。定义矩阵,输入数据