光行资源网提供DNASTAR安卓版是致力于DNA剖析设计室打造出的一款分子生物学软件,该软件由MapDraw、GeneQuest、MegAlign等七大可单独运作的控制模块构成,而且还内嵌了超多技术专业的作用,能够轻轻松松开展DNA和蛋白编码序列剖析、重叠群拼凑和基因工程技术管理方法。
DNASTAR全名DNASTAR Lasergene,是可以给予相关生物学、分子生物学、结构生物学等大量作用的综合型编码序列专用工具软件,可以轻轻松松完成DNA潜在性剖析、蛋白质的功能剖析等,日前被广泛运用于医药学层面,有要求的盆友可以下载应用。
DNASTAR Lasergene功能
1、Editseq
用来将DNA或蛋白质序列的数据输入计算机的根据,同时还具有编辑已有序列的功能
2、MegAlign
对DNA或蛋白质序列进行同源比较,有六种不同的对准算法供用户选择,在同源比较的同时,能很快输出进化树和进化距离等数据
3、GeneQuest
可帮助查找和注释DNA序列中的基因和其他特征序列,包括ORFs、剪接位点、转录因子结合位点、重复序列和酵切位点等
4、MapDraw
支持酵切图谱分析、克隆实验设计、分析及处理实验结果等,同时还具有绘制质粒图谱的功能
5、PrimerSelect
设计PCR引物、测序引物和探针
6、Protean
分析和预测蛋白质结构,提示各种分析方法并以图形的格式输出结果,并能显示蛋白质分子的各种理论化特性以及例如抗原决定族等功能区的预测功能
7、SeqMan II
多序列拼接。最多支持64000条序列的同时拼接。且在拼接前可以对序列进行修正,对自动测序的序列结果可除去污染序列或载体序列。整个拼接过程即时显示,并提示可能的完成时间。拼接结果采用序列、策略等方式显示。
内置模块
SeqBuilder:可视化和序列编辑
SeqMan Pro:序列集结和SNP发现
MegAlign:序列组合
PrimerSelect:oligo primer 设计
Protean:蛋白质结构分析和预测
GeneQuest:基因查找
EditSeq:导入特殊文件工具
安装步骤
1、在本站下载DNASTAR压缩包并解压,在解压的目录中找到;.exe”文件双击运行安装;
2、进入软件安装向导后,点击;Next”;
3、阅读用户使用协议后,点击;YES”表示同意协议;
4、选择文件的安装目录后,点击;Next”,如果想要自定义安装目录的话,点击;Browse...”选择安装位置
5、然后显示的是软件安装信息,用户直接点击;Next”即可;
6、软件安装中,请等待安装完成即可。
使用方法
1、创建一个新项目或打开一个现有的找到项目。
2、选择分析>显示可用的方法以显示方法列表,并选择要应用到序列中的哪些方法。您可能希望遵循本章后面所述的定位潜在基因的正式策略。
3、将您想要的方法从更多方法菜单移到方法帘幕。通过将鼠标从方法幕拖到检测表面,在序列中应用方法,如果它们还没有在。
4、以图形或表格的形式查看结果。
5、随时编辑方法参数。然后添加、删除、重新排列和;装饰”方法,直到您满意文档的外观为止。
6、使用图形和表格的结果来形成关于序列的假设,然后注释任何有趣的特性。
7、搜索爆炸或Entrez数据库匹配序列,或其他感兴趣的序列。
8、保存结果。
9、如果需要,打印结果。
10、文件>退出(赢)或找到>退出(MAC)退出找到。
使用DNAStar打开基因序列
1、复制序列
我们搜索到序列后,点击打开序列。我们可以看到前半部分是有关序列的详细说明,后面则是序列原文。我们选定序列区域,右键;复制”。
2、直接粘贴
将序列复制后,打开DNAStar——;EditSeq”,右键新建的文件空白处,选择;粘贴”,出现提示,点击OK,序列就被拷贝出来了。分析完成后记得点击;保存”哦,不然还得重新下载。
3、新建txt文件
其实,DNAStar中的EditSeq”也能识别txt文档,将复制的序列粘贴到txt文档后,再拖拽到EditSeq,也是能打开序列文件的,但需要我们将序列前面的数字去掉,保持序列的连续性即可。
DNA序列GC含量计算
1、下载安装DNASTAR。
2、选择EditSeq这个程序,此程序的功能是分析GC含量、查找某个位置的碱基、碱基校对、DNA序列翻译为氨基酸序列、序列反向互补、序列反向等等。
3、复制粘贴你要分析的DNA序列,然后选中所有的DNA序列。注意如果不选中,相应的选项是无法应用的。
4、点击标题栏中;Goodies”》DNA statistics,如下图所示:
5、然后在弹出的窗口中可以看到GC含量,甚至每个碱基ATGC各自含量都可以准确算出来。
6、返回第4步,在DNA statistics 上面可以看到;Translate DNA”,点击之后再弹出的窗口中可以看到翻译后的氨基酸序列。
添加新酶步骤
您可以使用酶管理器手动添加新的酶到SeqBuilder。
1、选择ENZYMES> New Enzyme。出现Enzyme Manager。
2、在酶名称中输入新限制酶的名称。
3、在识别序列文本框中键入识别序列。
4、从类列表框中选择酶的类别(精确,随机或未知)。
如果课程是精确的,你可以设置上部线条和下部切割点。将识别序列上方和下方的箭头拖到适当的位置。顶部箭头表示上部切割部位,下部箭头表示下部切割部位。
5、(可选)在;Isoschizomers”列表框中输入任何市售异构体的名称,方法是单击框并键入isoschizomers。
6、(可选)通过单击框内输入三字母代码,将供应商的三字母代码输入;供应商”列表框。
7、(可选)输入成本值和单位编号,输入单位成本。
8、(可选)通过检查On Hand或Procurable来定义酶的可用性。
9、单击;确定”将新酶添加到库中。
DNASTAR Lasergene特色
1、分子生物学的一套房
手机软件开展序列比对,遗传基因发觉、Sanger重叠群安装,全自动标明的复制质粒与引物设计。
2、分子生物学精义
包含编码序列编写、全自动质粒注解、复制和引物设计的应用软件。
3、基因组学的关键点
大家的分子生物学基本包加genvision亲,可视化,访问和较为基因数据信息。
4、结构生物学精义
大家的分子生物学基本包再加上千姿百态的三维,探寻生物大分子的构造、健身运动和作用。
5、基因组学模块
NGS安装手机软件和剖析给予一个形象化的操作界面,内嵌的提升主要参数和无以伦比的精密度。
6、结构生物学模块
用以蛋白编码序列剖析、生物大分子可视化和构造预测分析的一组健硕专用工具。
DNASTAR是专为DNA分析设计所打造的一款生物学软件!该软件由MapDraw、GeneQuest、MegAlign等七大可独立运行的模块组成,并且还内置了超多专业的功能,可以轻松进行DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理。分子生物学的套房,分子生物学精要